README

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-# Protocole du TP:
+# Project Protocol:
 
 ## Description 
-Ce projet automatise l'exécution de quatre scripts R pour une analyse GWAS à l'aide d'un Makefile, garantissant ainsi un processus totalement automatisé.
+This project automates the execution of four R scripts for a GWAS analysis using a Makefile, ensuring a fully automated process.
 
-## Installation de micromamba 
-Les instructions d'installation de micromamba se trouvent dans le fichier `doc/01install.md`.
+## Installation of micromamba 
+Installation instructions for micromamba can be found in the `doc/01install.md` file.
 
-## Utilisation des containers
+## Using Containers
+Instructions for using the containers can be found in the `doc/01install.md` file.
 
-1.**Construire l'image Docker:**
-	-Accédez au dossier **containers**
-	-Exécutez la commande suivante dans le terminal :
-		docker build -t Dockerfile
+## Execution
+Steps for running the analysis are detailed in the `doc/02run.md` file.
 
-2.**Convertir l'image Docker en fichier SIF:**
-	-Assurez-vous que le fichier `m2bsgreprod.def` est dans le dossier **containers**
-	-Exécutez la commande suivante :
-		sudo apptainer build results/containers/m2bsgreprod3.sif results/containers/m2bsgreprod.def
-
-## Exécution
-Les étapes pour exécuter l'analyse sont détaillées dans le fichier `doc/02run.md`. 
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-## Organisation des dossiers 
-**containers** : définitions de l'image virtuelle avec les versions spécifiques des logiciels et packages requis
-**doc** : documentation d'installation et d'exécution 
-**src** : scripts R pour l'analyse GWAS
-**workflows** : makefile pour exécuter les scripts dans l'ordre nécessaire
-**.gitignore** : fichiers à exclure de la publication
-**RELEASE.md** : historique des versions de git 
+## Directory Organization 
+**containers** : Definitions of the virtual image with specific versions of the required software and packages.
+**doc** : Documentation for installation and execution.
+**src** : R scripts for the GWAS analysis.
+**workflows** : Makefile to run the scripts in the correct order.
+**.gitignore** : Files to be excluded from publication.
+**RELEASE.md** : Git version history.
 
 ## Version 
-Pour obtenir des informations sur la version, veuillez consulter le commit et la branche indiqués dans le fichier `RELEASE.md`.
+To obtain version information, please consult the commit and branch indicated in the `RELEASE.md` file.